1、病原体不同，一个是细菌感染，一个是由于病毒感染。

2、临床表现不同，细菌感染常伴有高热，寒战等，病毒感染会有乏力，肌肉酸痛等。

3、辅助检查指标不同，特别是血常规不同，细菌感染，白细胞以及中性粒细胞升高，病毒感染，淋巴细胞和单核细胞升高。

4、治疗方案，细菌感染使用抗生素，病毒感染使用抗病毒药物。