区别：

神曲：又名药曲。是用面粉，鼓皮，鲜青篙，苍耳草，辣寥草，杏仁泥，赤豆粉共六味药研厂末混合后经发酵而成的加工制品，故亦秐六曲。具有消食健胃之功。适用于食积不消，院腹胀满，食少泄泻等证。

红曲：为粳米饭入曲母蒸窖制品。具有消食活血，健脾和胃的功效。