矮牵牛花种皮形状为近球形，直径约0.8-1.3厘米，大概3瓣裂。种子为卵状的三棱行，长约6毫米，颜色为米黄色或者黑褐色。它的种子成熟期是不一样的，成熟之后容易开裂，要随熟随采。开裂之后就要将种子取出来，放在阴凉且干燥的地方。到春秋季播种最好，温度更适宜，成活率会更高。