弹涂鱼为暖水性近岸小型底层鱼类。弹涂鱼具有挖钻孔道而栖息的习性，其孔口至少有两个，一处为正孔口，是出入的主通道；另一处为后孔口，是出入的支通道。孔道为“丫”型，也可做产卵室。冬季水温14℃以下时躲藏于洞穴越冬。有太阳的好天气，即使是冬季也会出来摄食活动。当水温低于10℃以下时，会深居于底穴洞中，休眠保暖过冬。大部分鱼类如果离开了水就会缺氧窒息而死。然而，弹涂鱼除了用鳃呼吸外，还可以凭借皮肤和口腔黏膜的呼吸作用来摄取空气中的氧气。弹涂鱼主要以底栖硅藻为食，常看到其在退潮时的浅滩与排水渠道的底部或两侧摄食底栖硅藻的情况。当鱼体被太阳晒干时即爬入水溜中，然后再游出水溜继续摄食底栖硅藻。