公司不发工资只交纳社保的话，如何申报个税，分以下情形：企业为员工缴纳的社保，分为单位承担部分与个人承担的部分。因此，企业为员工缴纳社保，工资为零，要分不同情况。如果企业不仅承担社保中企业应承担的部分，还承担个人应承担的社保部分，那么当月该员工的工资实际上为企业帮个人承担社保的那部分；如果企业只承担缴纳的社保费用中由企业承担的部分，个人应承担的社保部分，个人以现金形式交给企业，或者从后期工资里扣除，则该员工的工资实际上为零。