农村土地确权登记后所颁发的土地承包经营权证书遗失的，可以向农业委员会申请补办。属于原来颁发的土地承包经营权证书丢失的，则不需要补办，可以直接申请重新确权登记。

【法律依据】《农村土地承包经营权证管理办法》第十七条规定，农村土地承包经营权证严重污损、毁坏、遗失的，承包方应向乡(镇)人民政府农村经营管理部门申请换发、补发。

经乡(镇)人民政府农村经营管理部门审核后，报请原发证机关办理换发、补发手续。