因为蒸发箱长期在潮湿和闷热的环境中工作，因此随着工作时间的延长，内部的细菌就会大量繁殖；若不定期进行清理，则会对乘坐人员的健康造成威胁。

若车主需要对车辆的蒸发箱进行清洗，建议前往专业的汽车修理厂请专业人士对其进行清洗，因为自己操作很容易造成其他零构件的移位；通常而言，每年都需要对蒸发箱进行清洗，若车主使用车辆的频率不高，则可以延长清洗的时间。